L'enquête se déroule selon la méthode des I.P.A. (Indice Ponctuel d'Abondance).
Un premier comptage a eu lieu au printemps 2003 du 29 mars au 6 avril et un second
à l'automne du 20 au 28 septembre.
Pour les années suivantes (l'enquête se fait sur cinq années au moins),
les vagues de printemps et d'automne sont programmées à des dates correspondantes.

Carte de répartition des points de la première vague d'observation
Mille points d'observations été répartis régulièrement par quadrillage
de la surface de Paris intra-muros. Des points sont ensuite tirés au sort
et attribués à des observateurs volontaires et bénévoles.
Pour la première période d'enquête, 110 points ont été observés par 39 observateurs,
ce qui donne un ratio statistique crédible. L'enquête s'est depuis étendue,
et le nombre de points observés tourne autour de 140.
Nous avons défini pour cette enquête un protocole facile à suivre.
L'observateur doit se poster au point indiqué, sans se déplacer, pendant exactement 10 minutes sans interruption.
Toute observation faite avant ou après ne doit pas être comptabilisée.
Il doit être attentif à tout moineau entré dans son champ de vision (sur 360°)
pendant cette période (sans jumelles). Il peut cependant utiliser les jumelles
pour distinguer les individus ou en déterminer le sexe.
Il remplit sa fiche d'observation en indiquant le nombre de moineaux vus ou entendus,
le plus grand groupe observé, la répartition mâles/femelles/jeunes (facultatif),
et d'autres informations complémentaires éventuellement.